Merujuk kepada tujuan pendidikan Kemendikbud dan cita-cita luhur pendiri bangsa, secara umum tujuan didirikannya SMP Sekolah Alam Gunung Mendelem adalah :

1. Memberikan pendidikan dengan sistem terbaik kepada generasi muda (usia SMP-SMA) demi masa depan yang lebih baik sehingga mampu survive menghadapi kompetisi, kolaborasi serta kompleksitas dunia di masa yang akan datang.
2. Membekali dan mengantarkan peserta didik untuk siap menjadi rahmatan lil ‘alamin (QS. Al Anbiya: 107) dan menjadi khalifatu fil ardh (QS Al Baqoroh: 30) dengan jalan senantiasa bersyukur (QS. Al A’raf: 10 & 58) dan tidak sombong (QS Al A’raf: 48) serta menjaga alam dan tidak membuat kerusakan di bumi (QS. Al A’raf: 56)
3. Membangun paradigma belajar yang menyenangkan sesuai dengan perkembangan neuroscience terapan.
4. Menyeimbangkan aspek pendidikan ruhiyah, fikriyah dan jasadiyah.
5. Menggabungkan sekolah yang dekat dengan masyarakat sekitar agar akses masyarakat ke pendidikan menjadi lebih mudah dan dampak pendidikan ke masyarakat juga bisa lebih besar.
6. Memberi manfaat kepada lingkungan serta berkontribusi dalam mencerdaskan kehidupan bangsa dan negara sebagaimana tercantum dalam pembukaan undang-undang dasar 1945 secara khusus dan peradaban dunia secara umum
7. Berkontribusi dalam pengembangan pendidikan nasional yang menerapkan prinsip demokratis, desentralisasi dan otonomi pendidikan yang menjunjung tinggi hak asasi sesuai dengan undang-undang no 20 tahun 2003 tentang Sistem Pendidikan Nasional.
8. Mewujudkan pendidikan yang berkualitas sebagai salah satu amanah Suistainable Development Goals (SDG’S)